L17 Laboratorij za molekularno modeliranje
|
Z razvojem in uporabo novih pristopov molekularnega modeliranja študiramo povezave med strukturo, dinamiko in funkcijo kompleksnih molekularnih sistemov.
VRANA – vzporedni računalnik za akceleracijo numeričnih algoritmov
V laboratoriju sestavljamo in vzdržujemo gruče VRANA in delovne postaje s programsko opremo v podporo pri raziskavah z računalniškimi simulacijami in modeliranjem. |
| |
|
ENZO, spletni strežnik za evaluacijo shem encimskih reakcij, dostopen na naslovu enzo.cmm.ki.si. Iz sheme samodejno izpelje pripadajoče diferencialne enačbe in prilega koeficiente enačb numeričnih rešitev k eksperimentalnim krivuljam.
Pripadajoči članek smo objavili v reviji PLoS ONE.
| |
|
Strežnik ProBiS, ki napoveduje vezavna mesta na proteinih, je dostopen na naslovu probis.cmm.ki.si. Prisoten je tudi na seznamih orodij za analizo proteinskih struktur na straneh RCSB PDB in Computational Chemistry List.
Pripadajoča članka smo objavili v revijah Bioinformatics in Nucleic Acids Research.
| |
|
