L-01 Laboratorij za računalniške bioznanosti in bioinformatiko
Laboratorij za računalniške bioznanosti in bioinformatiko se ukvarja z molekulskimi simulacijami biološko in tehnološko zanimivih sistemov in procesov, raziskavami novih zdravil, učinkovin ter bioinformatiko.
| |
|
Novice
Članek na naslovnici EJOC | Zimska šola EVB | ||
Skupina raziskovalcev Laboratorija za računalniške bioznanosti in bioinformatiko je objavila članek o ireverzibilni inhibiciji monoamino-oksidaze B v Eur. J. Org. Chem., ki je bil izbran tudi za naslovnico izdaje, v kateri je bil članek objavljen. |
| Gostili smo S.C. Lynn Kamerlin z univerze v Uppsali, ki je med 26. in 29. oktobrom 2011 vodila zimsko šolo EVB (empirical valence bond) v obsegu 30 ur. Osredotočili smo se predvsem na uporabo EVB v računski encimologiji, zlasti kot uporabno orodje za preučevanje encimskih mehanizmov. |
|
Zadnje publikacije
BRVAR, Matjaž, PERDIH, Andrej, HODNIK, Vesna, RENKO, Miha, ANDERLUH, Gregor, JERALA, Roman, ŠOLMAJER, Tomaž. In silico discovery and biophysical evaluation of novel 5-(2-hydroxybenzylidene) rhodanine inhibitors of DNA gyrase B. Bioorg. med. chem.. [Print ed.], 2012, str. [1-11]., doi: 10.1016/j.bmc.2012.02.052. [COBISS.SI-ID 4919578] Izvirni članek.
PERDIH, Andrej, SOLLNER DOLENC, Marija. Recent advances in the synthesis of unnatural [alpha]-amino acids - an updated version. Curr. org. chem., 2011, vol. 15, no. 22, str. 3750-3799. [COBISS.SI-ID 3129713] Izvirni članek.
BORŠTNAR, Rok, REPIČ, Matej, KRŽAN, Mojca, MAVRI, Janez, VIANELLO, Robert. Irreversible inhibition of monoamine oxidase B by the antiparkinsonian medicines rasagiline and selegiline : a computational study. European journal of organic chemistry, 2011, 16 str., ilustr., doi: 10.1002/ejoc.201100873. [COBISS.SI-ID 4788506] Izvirni članek.
MINOVSKI, Nikola, JEZIERSKA-MAZZARELLO, Aneta, VRAČKO, Marjan, ŠOLMAJER, Tomaž. Investigation of 6-fluoroquinolones activity against Mycobacterium tuberculosis using theoretical molecular descriptors : a case study. Cent. Eur. J. Chem. (Print), 2011, vol. 9, no. 5, pp. 855-866, ilustr., doi: 10.2478/s11532-011-0071-1. Izvirni članek.
MINOVSKI, Nikola, PERDIH, Andrej, ŠOLMAJER, Tom, Combinatorially-generated library of 6-fluoroquinolone analogs as potential novel antitubercular agents: a chemometric and molecular modeling assessment. J. Mol. Model., 2011, doi: 10.1007/s00894-011-1179-0 Izvirni članek.
STARE, Jernej, MAVRI, Janez, GRDADOLNIK, Jože, ZIDAR, Jernej, MAKSIĆ Zvonimir B., VIANELLO Robert, Hydrogen Bond Dynamics of Histamine Monocation in Aqueous Solution: Car-Parrinello Molecular Dynamics and Vibrational Spectroscopy Study. J. Phys. Chem. B, 2011, vol. 115, no. 19, pp. 5999-6010. Izvirni članek.
KRŽAN, Andrej, MAVRI, Janez. Atomic volume as a descriptor for carbon electronic structure and stability. J. Org. Chem, 2011, vol. 76, no. 6, pp. 1891-1893. Izvirni članek.
MINOVSKI, Nikola, VRAČKO, Marjan, ŠOLMAJER, Tomaž. Quantitative structure-activity relationship study of antitubercular fluoroquinolones. Molecular diversity, 2011, vol. 15, no. 2, pp. 417-426. Izvirni članek.
ZIDAR, Jernej, MERZEL, Franci. Probing amyloid-beta fibril stability by increasing ionic strengths. J. phys. chem., B Condens. mater. surf. interfaces biophys., 2011, vol. 115, no. 9, pp. 2075-2081. Izvirni članek.
BILIŠKOV, Nikola, KOJIĆ-PRODIĆ, Biserka, MALI, Gregor, MOLČANOV, Krešimir, STARE, Jernej. A partial proton transfer in hydrogen bond O-H [times] [times] [times] O in crystals of anhydrous potassium and rubidium complex chloranilates. J. phys. chem., A Mol. spectrosc. kinet. environ. gen. theory, 2011, vol. 115, no. 14, pp. 3154-3166. Izvirni članek.
KAMERLIN, Shina Caroline Lynn, MAVRI, Janez, WARSHEL, Arieh. Examining the case for the effect of barrier compression on tunneling vibrationally enhanced catalysis, calalytic entropy and related issues. FEBS Lett., 2010, vol. 584, no. 13, pp. 2759-2766. Izvirni članek.
PERDIH, Andrej, KOTNIK, Miha, OBLAK, Marko, ŠOLMAJER, Tomaž. Uporaba Računalniške Kemije pri Načrtovanju in Iskanju Novih Spojin Vodnic - The Use of Computational Chemistry in the Design and Screening of Novel Lead Compounds. Farm. Vestn., 2010, let. 61, no. 4, pp. 195-202. Izvirni članek.
