Novica

Ljubljana, 19. november 2020 - Na Kemijskem inštitutu smo razvili hitri test za zaznavanje prisotnosti virusa SARS-CoV-2 v slini. S testom, imenovanim RT-LAMP, dobimo rezultate v 30 minutah pomnoževanja virusne RNA brez drage laboratorijske opreme. Za zdaj je to informativni test, ki pa ga želimo v kratkem validirati na še večjem številu vzorcev testirancev ter ga prekvalificirati v diagnostični test. Z njegovo uporabo bi bila diagnostika okuženih z virusom SARS-CoV-2 občutno hitrejša in enostavnejša, pa tudi dostopnejša.

Gre za hitri test na osnovi izotermne amplifikacije oziroma tehnologije LAMP (Loop-mediated Isothermal Amplification), ki je dovolj občutljiv, da zazna virus SARS-CoV-2 pri infektivnih osebah in ga uporabljajo že marsikje po svetu. Test smo na Kemijskem inštitutu prilagodili in izboljšali nekatere uporabljene reagente. Ker je test enostaven za uporabo in zahteva samo enostavno opremo, ga je mogoče izvajati na mestu obravnave. S pomočjo omenjenega testa lahko močno poenostavimo, predvsem pa pospešimo proces odkrivanja prenašalcev tega nevarnega virusa.

^{Foto: Hitri test, ki smo ga razvili, je osnovan na tehnologiji LAMP}

^{Vir: Kemijski inštitut}

Povečanje števila testov tudi preko rutinskega testiranja zaposlenih v podjetjih in ustanovah bi lahko pomembno zmanjšalo število okužb in omogočilo pot k normalnem delovanju družbe. Ključno pri omenjenem testu je, da se lahko za vzorec uporablja slino (lahko tudi brise iz nosne votline in žrela). Občutljivost testa je nad 100,000 kopij virusne RNA/ml sline, kar je sicer nekoliko slabše od PCR metode kot zlatega standarda, vendar dovolj, da z njim zaznamo tudi asimptomatske infektivne osebe. Osebe, ki so infektivne, imajo namreč v slini prisotno močno povečano število virusov. S to metodo testiranja so tako uspešno zaznali asimptomatske prenašalce virusa, ki pri širjenje okužbe predstavljajo velik problem, saj se tega, da so okuženi, najpogosteje niti ne zavedajo. Od pripomočkov oziroma naprav, ki so potrebni za analizo, zadošča vodna kopel z nastavljivo konstantno temperaturo.

K razvoju opisane metode je pristopila tudi Klinika za infekcijske bolezni in vročinska stanja, UKC Ljubljana. Z njihovo pomočjo smo uspeli hitri test RT-LAMP pripeljati do te ravni, da mu lahko zaupamo. V skladu z našimi raziskavami test izkazuje 90 odstotno zanesljivost. Ob tem posebej poudarjamo, da gre zaenkrat za test informativne narave, ki pa lahko poda informacijo za osamitev infektivnega posameznika.

^{Grafika: metoda Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP)}

^{Vir: en.wikipedia.org/wiki/Reverse_Transcription_Loop-mediated_Isothermal_Amplification}

Da bi omenjeni hitri test lahko prekvalificirali iz informativnega v diagnostični test, pa bi ga bilo vsekakor potrebno validirati na večjem številu vzorcev testirancev. To pa je naslednja faza razvoja naših hitrih testov. Želimo si, da bi pri tem prišlo do sodelovanja z ustanovami, ki so neposredno vpete v analizo vzorcev iz tako imenovanih COVID točk, kjer opravljajo testiranja. Na ta način bi lahko ustrezno validirali na Kemijskem inštitutu razviti hitri test, ki bi nato služil kot podpora za hitre, zadostno občutljive presevne teste, ki bi infektivno populacijo ločili od zdrave.

Raziskovalci so pri projektu razvoja hitrega testa za zaznavanje prisotnosti virusa SARS-CoV-2 oprli na več poročil, ki opisujejo primere implementacije tega principa, kot je članek na strežniku bioRxiv: A rapid, highly sensitive  and open-access SARS-CoV-2 detection assay for laboratory and home testing (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.23.166397v2).

V raziskovalni skupini sodelujejo sodelavci Odseka za sintezno biologijo in imunologijo Kemijskega inštituta in sicer Eva Rajh, Tina Šket, Arne Praznik, dr. Petra Sušjan, Sanjin Lulić, izr. prof. dr. Mojca Benčina in prof. dr. Roman Jerala, ter zdravnici doc. dr. Tatjana Lejko Zupanc in dr. Gabriele Turel, obe s Klinike za infekcijske bolezni in vročinska stanja, UKC Ljubljana.

Znanje za izvedbo testa smo na Kemijskem inštitutu pripravljeni deliti z vsemi zainteresiranimi za nekomercialne namene.

Več informacij: mojca.bencina(at)ki.si