Odseki

Nacionalni NMR center na KI ponuja dostop do raziskovalne infrastrukture in strokovno znanje na področju NMR spektroskopije raziskovalcem v akademskih institucijah in v industriji od svoje ustanovitve leta 1992. NMR center razpolaga z moderno raziskovalno opremo, ki obsega en 800 MHz, pet 600 MHz in en 400 MHz NMR spektrometer visoke ločljivosti, katerih kakovost je odločilnega pomena za izvajanje najbolj zahtevnih raziskav. Te zajemajo študij strukture in dinamike biološko pomembnih (makro)molekul ter njihovih interakcij, procesov pri shranjevanju energije (operando meritve), določanje neželenih stranskih produktov v zdravilih, določanje kakovosti in geografskega izvora slovenskih vin in medu, GMP certificirane kvalitativne in kvantitativne analize, ipd. NMR spektrometri so na razpolago vsem ustanovam in podjetjem, ki jih potrebujejo pri svojem delu. Visoko usposobljen kader s svojim znanjem za uporabo ter vzdrževanje NMR spektrometrov visokega polja omogoča, da so vsi spektrometri in pripadajoča oprema ves čas v optimalnem stanju za konkretne aplikacije uporabnikov. Podpora, ki jo NMR center nudi v sodelovanju z akademskimi inštitucijami omogoča številne objave v kakovostnih znanstvenih revijah. Nacionalni NMR center je hkrati tudi partnerska zmogljivost in zastopajoči subjekt Slovenije v CERIC ERIC, ki omogoča povezovanje nacionalne multidisciplinarne analitike, sinteze in zmogljivosti za pripravo vzorcev na opremi partnerjev. Gre za raziskovalno infrastrukturo organizirano na ravni EU, odprto za raziskovalce na svetovni ravni.

1. Medved N., Cevec M., Javornik U., Lah J., Hadži S., Plavec J. Beyond Structure: Methylation Fine-Tunes Stability and Folding Kinetics of bcl2Mid G-Quadruplex. Angew. Chem. Int. Ed. 2025, 64(24), e202507544. https://doi.org/10.1002/anie.202507544
2. Aleksič S., Podbevšek P., Plavec J. Oxidative events in a double helix system promote the formation of kinetically trapped G-quadruplexes. Nucleic Acids Res. 2025, 53(6), gkaf260. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf260
3. Takahashi S., Ghosh S., Trajkovski M., Ohyama T., Plavec J., Sugimoto N. Twisting tetraplex DNA: A strand dynamics regulating i-motif function in diverse molecular crowding environments. Nucleic Acids Res. 2025 53(12), gkaf500. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf500
4. Sahoo B.R., Deng X., Wong E.L., Clark N., Yang H.J., Kovalenko A., et al. Visualization of liquid-liquid phase transitions using a tiny G-quadruplex binding protein. Nat. Commun. 2025, 16(1), 8578. https://doi.org/10.1038/s41467-025-63597-7
5. Ruggiero E., Marušič M., Zanin I., Peña Martinez Cristian D., Christ D., Plavec J., et al. The iMab antibody selectively binds to intramolecular and intermolecular i-motif structures. Nucleic Acids Res. 2025, 53(2), gkae1305. https://doi.org/10.1093/nar/gkae1305
6. Pevec M., Medved T., Kovačič M., Žerjav N., Imperl J., Plavec J., et al. Structural basis of G-quadruplex recognition by a camelid antibody fragment. Nucleic Acids Res. 2025, 53(10), gkaf453. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf453
7. Trajkovski M., Pastore A., Plavec J. Dimeric structures of DNA ATTTC repeats promoted by divalent cations. Nucleic Acids Res. 2024, 52(4), 1591–601. https://doi.org/10.1093/nar/gkae052
8. Sahoo B.R., Kocman V., Clark N., Myers N., Deng X., Wong Ee L., et al. Protein G-quadruplex interactions and their effects on phase transitions and protein aggregation. Nucleic Acids Res. 2024, 52(8), 4702–22. https://doi.org/10.1093/nar/gkae229
9. Javornik U., Pérez-Romero A., López-Chamorro C., Smith R.M., Dobado J.A., Palacios O., et al. Unveiling the solution structure of a DNA duplex with continuous silver-modified Watson-Crick base pairs. Nat. Commun. 2024, 15(1), 7763. https://doi.org/10.1038/s41467-024-51876-8
10. Hadži S., Živič Z., Kovačič M., Zavrtanik U., Haeserts S., Charlier D., et al. Fuzzy recognition by the prokaryotic transcription factor HigA2 from Vibrio cholerae. Nat. Commun. 2024, 15(1), 3105. https://doi.org/10.1038/s41467-024-47296-3