Reverzibilno pH stikalo med dvema G-kvadrupleksoma iz človeškega telomernega zaporedja
Telomerni konci sesalcev vsebujejo heksanukleotidne ponovite TTAGGG, ki imajo pomembno vlogo v procesih staranja in pri razvoju rakastih obolenj. Oligonukleotidi s temi DNA zaporedji se lahko zvijejo v različne G-kvadruplekse glede na prisotnost različnih kationov, heterocikličnih ligandov, pogojev v okoliški raztopini in specifiko oligonukleotidnega zaporedja. Pomembna potencialna vloga G-kvadrupleksov z antiparalelnim tipom topologije v obliki košare nas je vzpodbudila k študiji oligonukleotida d[TAGGG(TTAGGG)2TTAGG] (htel1-DG23).
NMR študija je pokazala, da ta oligonukeotid v prisotnosti KCl tvori dve različni G-kvadrupleksni strukturi, ki vsebujeta po dva G-kvarteta. Populaciji obeh oblik določa pH raztopine. (De)protonacija A20 je ključnega pomena za strukturno pretvorbo htel1-DG23. Reverzibilnost procesa ponuja možnosti za njegovo uporabo kot konformacijskih stikal znotraj celic, ki kontrolirajo interakcije s specifičnimi ligandi in proteini.
Vir:
Petra Galer, Baifan Wang, Primož Šket and Janez Plavec, Reversible pH switch of two-quartet G-quadruplexes formed by human telomere, Angew. Chem. Int. Ed. 2016, doi: 10.1002/anie.201507569
