Vpogled v mehanizme reguliranja tvorbe por gasdermina D
Šifra projekta: N1-0120
Obdobje trajanja projekta: 1. 9. 2019 - 28. 2. 2021
Vodja: dr. Magdalena Kulma
- VSEBINSKI OPIS PROJEKTA:
Namen tega projekta je bil razširiti sedanje znanje o mehanizmu tvorbe por s pomočjo gasdermina D (GSDMD). GSDMD je ključni efektor piroptotične celične smrti. Piroptoza je zelo vnetna oblika programirane celične smrti, ki se najpogosteje pojavi ob okužbi z intracelularnimi patogeni in je verjetno del protimikrobnega odziva. Predlagano je, da piroptotična celična smrt poteka prek tvorbe por plazemske membrane GSDMD, ki je bila identificirana kot substrat kaspaze in bistveni posrednik piroptoze. Aktivnost N-terminalne domene GSDMD, ki tvori pore, povzroči lizo celic, da prepreči razmnoževanje znotrajceličnih patogenov, in je potrebna za sproščanje citoplazemske vsebine, kot so vnetni citokini, da pridobijo in aktivirajo imunske celice na mestu okužbe.
- Osnovni podatki glede financiranja:
Projekt financira ARRS v okviru cenovne kategorije D za obdobje 18 mesecev v obsegu 1700 letnih ur. Pričetek financiranja je 1. 7. 2019.
- Sestava projektne skupine s povezavami na SICRIS:
Na Kemijskem inštitutu v projektni skupini sodeluje:
53439; Magdalena Kulma - Faze projekta in njihova realizacija
Study of GSDMD-N interaction with the lipid membrane. This step of the project was focused on the role of the basic amino acid-enriched regions in the interaction of GSDMD with lipid membranes.
a) GSDMD mutant derivatives preparation.
b) Analysis of lipid binding specificity.
c) Liposome binding analysis.
Study of lipid composition impact on the architecture of the GSDMD-N oligomers
The part of the project was focused on the determination of lipid composition facilitating the formation of specific forms of oligomers that lead to pore formation.
a) Analysis of oligomerization.
b) Pore-forming activity measurement.
Structural rearrangement of GSDMD-N during oligomerization
- Bibliografske reference, ki izhajajo neposredno iz izvajanja projekta
Kulma, M., Anderluh, G. Beyond pore formation: reorganization of the plasma membrane induced by pore-forming proteins. Cell. Mol. Life Sci. 78, 6229–6249 (2021).
Kulma M, Podobnik M, Anderluh G. Relationship between lipid bilayer composition and gasdermin D activity FEBS OPEN BIO 11, 380-380
