Skip to main content

Odseki

Laboratorij za računsko biokemijo in načrtovanje učinkovin

Naše delo je usmerjeno v (a) molekularno farmakologijo centralnega živčnega sistema s poudarkom na metabolizmu monoaminov in (b) načrtovanje novih protibakterijskih in protirakavih učinkovin. Uporabljamo širok nabor simulacijskih orodij, ki vključujejo večnivojsko modeliranje in sodobna orodja za načrtovanje zdravilnih učinkovin.

Sodelavke in sodelavci

Vodja laboratorija
Doktorandke in doktorandi

Reprezentativne publikacije

  1. PRAH, Alja, FRANČIŠKOVIĆ, Eric, MAVRI, Janez, STARE, Jernej. Electrostatics as the driving force behind the catalytic function of the monoamine oxidase a enzyme confirmed by quantum computations.ACS catalysis. 2019, 9, 1231-1240
  2. JANEŽIČ, Matej, VALJAVEC, Katja, BERGANT LOBODA, Kaja, HERLAH, Barbara, OGRIS, Iza, KOZOROG, Mirijam, PODOBNIK, Marjetka, GOLIČ GRDADOLNIK, Simona, WOLBER, Gerhard, PERDIH, Andrej. Dynophore-based approach in virtual screening : a case of human DNA topoisomerase IIα. International journal of molecular sciences 2021, vol. 22, iss. 24, 13474.
  3. PERDIH, Andrej, HRAST, Martina, BARRETEAU, Hélene, GOBEC, Stanislav, WOLBER, Gerhard, ŠOLMAJER, Tomaž. Inhibitor design strategy based on an enzyme structural flexibility: a case of bacterial MurD ligase. Journal of Chemical Information and Modeling, 2014, 54, 1451-1466.
  4. OANCA, Gabriel, STARE, Jernej, MAVRI, Janez. How fast monoamine oxidases decompose adrenaline? Kinetics of isoenzymes A and B evaluated by empirical valence bond simulation. Proteins, 2017, 85, 2170-2178.
  5. STARE, Jernej. Complete sampling of an enzyme reaction pathway : a lesson from gas phase simulations. RSC advances,2017, 7,  8740-8754.
Za slepe in slabovidne(CTRL+F2)
barva kontrasta
velikost besedila
označitev vsebine
povečava