CC-LEGO: robust protein blocks to build cages and layers
Načrtovanje novih proteinov ponuja prednosti brez primere za zdravje ljudi, kot so izboljšana cepiva, nova zdravila in nove terapije (npr. zaviralec gripe, zdravljenje Alzheimerjeve bolezni). Najsodobnejše samo-sestavljanje proteinskih nanomaterialov temelji na oblikovanju novih interakcij protein-protein. Vendar pa je zaradi zapletenega medsebojnega delovanja številnih šibkih interakcij na vmesniku stopnja uspešnosti oblikovanih materialov trenutno pod 10%.
Cilj tega predloga je povečati stopnjo uspešnosti oblikovanja velikih proteinskih sklopov z uporabo obvitih vijačnic (ang coiled coils - CC) na vmesniku. CC so nekateri izmed najbolje razumljenih proteinskih motivov in jih je mogoče oblikovati z visoko stopnjo uspešnosti (> 50 %). Nabor dobro definiranih gradnikov (CC-LEGO) bo ustvarjen s togo združitvijo CC snopov in naravnih oligomerizacijskih domen.
Zaradi natančnega nadzora kotov, ki ga omogoča togo zlitje, pričakujemo, da bodo imele strukture CC-LEGO visoko stopnjo uspešnosti načrtovanja in visoko homogenost, ki je potrebna za nadaljnje aplikacije. Oblikovan in eksperimentalno preizkušen bo set gradnikov CC-LEGO, ki bodo sposobni tvoriti kletke (tetraedre, kocke, dodekaedre) in 1D vlakna.
Pomemben vpliv projekta je tudi prenos znanja o oblikovanju proteinov z Univerze v Washingtonu v slovenski in regionalni raziskovalni ekosistem, s čimer se poveča njegova odličnost.