Laboratorij za molekularno strukturno dinamiko
Naše raziskave se osredotočajo na stukturo, dinamiko in kinetiko biomolekularnih sistemov za vpogled v njihovo funkcijo in molekularne mehanizme. Pri tem združujemo linearno in ultra hitro vibracijsko spektroskopijo, NMR spektroskopijo in visoko zmogljivo računanje s pridruženimi naprednimi teoretičnimi in računskimi orodji za podrobno analizo eksperimentalnih in simuliranih podatkov. V ospredju raziskav je razumevanje molekularne dinamike na različnih časovnih skalah.
Naše delo ima vpliv in prispevek na področju načrtovanja in razvoja zdravil ter razumevanja molekularnih osnov bolezni.
Glavne usmeritve raziskav
I) Hidratacija, hidrofobnost, vodikova vez, agregacija
Raziskujemo fizikalno kemijske principe, ki so v ozadju solvatacije, strukture proteinov in agregacije. Pri tem uporabljamo vibracijsko spektroskopijo v kombinaciji s kemometričnimi orodji in atomistične simulacije.
II) Dinamika biomolekularnih interakcij
Poglabljamo razumevanjem kinetike in mehanizmov zapletenih biomolekularnih procesov. Pri tem uporabljamo NMR spektroskopijo v kombinaiji z analitičnimi orodji, simulacije molekularne dinamike, stohastične simulacijske metode in lastno razvite računske pristope.
III) Neurejeni proteini, biokondenzacija, z boleznimi povezane biomolekularne spremembe
Raziskujemo biološke funkcije in disfunkcijo intrinzično neurejenih proteinov in njihovo vlogo pri separaciji celičnih faz ter raznovrstnost biokemijskih sprememb v tkivih zaradi bolezni. Pri tem uporabljamo vibracijsko in NMR spektroskopijo ter simulacijske metode, obogatene s spremljajočimi teoretičnimi in računskimi pristopi.